Staphylococcus aureus résistant a la méticilline dans la mucoviscidose : évolution et adaptation au cours des infections chroniques

    Lafon, Marion (2025)
Thèse d’exercice
    Type de document
    Thèse d'exercice
    Diffusion
    Accès libre
    Titre en français
    Staphylococcus aureus résistant a la méticilline dans la mucoviscidose : évolution et adaptation au cours des infections chroniques
    Auteur
    Lafon, Marion
    Directeur de thèse
    Doléans-Jordheim, Anne (1976-....)
    Date de soutenance
    2025-01-24
    Établissement de soutenance
    Université de Toulouse
    Faculté
    Sciences pharmaceutiques
    Sujet
    Pharmacie
    Mots-clés libres
    Mucoviscidose
    Infection
    Staphylococcus aureus
    SARM
    Résumé en français
    Dans les infections survenant au cours de la mucoviscidose, Staphylococcus aureus est l'un des pathogènes les plus souvent isolés dans les poumons des patients. Les infections liées à cette bactérie sont particulièrement préoccupantes lorsqu'elles sont causées par des souches résistantes à la méticilline (SARM). Plus particulièrement, les infections chroniques sont associées à une détérioration clinique majeure. Afin d'étudier les mécanismes permettant l'adaptation et la persistance des SARM dans les poumons des patients atteints de mucoviscidose, nous avons réalisé une étude longitudinale comparant pour onze patients MV infectés chroniquement, la même souche de SARM isolée à deux temps différents : au moment de la primo-infection et pendant l'infection chronique. Pour chaque couple d'isolat, nous avons évalué la réponse à des stress extérieurs (présence d'antibiotiques ou d'autres bactéries telles que Pseudomonas aeruginosa, stress oxydatif) ainsi que leur capacité à former du biofilm. Les isolats chroniques produisent une biomasse plus importante au sein du biofilm et sont mieux adaptés à la coexistence avec Pseudomonas aeruginosa. Parallèlement, les isolats ont été séquencés et nous avons observé que les polymorphismes nucléotidiques identifiés affectent majoritairement les fonctions métaboliques et le traitement de l'information génétique. Des analyses approfondies sont nécessaires pour étudier l'impact de ces mutations notamment sur les phénotypes. L'ensemble des caractéristiques phénotypique et génotypiques mises en évidence sont d'autant plus de facteurs à mettre en perspective avec l'impact clinique des SARM dans les MV. Cette étude ouvre la voie pour identifier et approfondir les mécanismes d'adaptation essentiels à la bactérie pour persister chez l'hôte et aggraver les symptômes pulmonaires.
    Résumé en anglais
    In Cystic Fibrosis, a genetic disease involving thicker mucus and opportunistic infections, Staphylococcus aureus is one of the main bacteria isolated in airways. This infection is particularly concerning when patients are colonized chronically, and when strains are resistant to methicillin (Methicillin Resistant S. aureus or MRSA). To assess how MRSA strains can adapt to cystic fibrosis airways, we conducted a longitudinal study where two MRSA isolates were collected from the same patient at two different times: one when the patient gets infected for the first time and the other during the chronic stage. We evaluated how initial and chronic isolates manage environmental stresses: antibiotic pressure, oxidative stress and interactions with Pseudomonas aeruginosa. We also assessed their biofilm formation ability and chronic isolates can produce more biomass in biofilm. We showed that chronic strains are more adapted to coexistence with Pseudomonas aeruginosa. Simultaneously, isolates were sequenced, and the single nucleotide polymorphisms identified mainly belonged to metabolism functions and genetic information processing. Deeper analyses are needed to further compare these sequencies and decipher how strains genetically evolve chronically. In the same way, many host-dependent factors impact their adaptation, and a larger sample size would be needed. This study provides keys to identify and investigate the adaptive mechanisms essential for the bacteria to persist in the host and exacerbate pulmonary symptoms.
    Date de publication
    2025-10-20
    Numéro national de thèse
    2025TOU32002

Citation bibliographique

Lafon, Marion (2025), Staphylococcus aureus résistant a la méticilline dans la mucoviscidose : évolution et adaptation au cours des infections chroniques [Thèse d’exercice]